提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
加拿大多伦多将上演“欢乐春节”海外新年戏曲晚会******
中新网多伦多1月16日电 加拿大中国戏曲艺术协会主办的2023年“欢乐春节”海外新年戏曲晚会将于1月29日大年初八在大多伦多地区列治文山市举行。
该晚会将分五大板块。一是“祥云贺岁”,由协助参演的体现京剧元素的舞蹈、武术渲染新春佳节欢乐祥和的氛围,京剧《天女散花》则将烘托出过大年唱大戏、看大戏的主题;二是“梨园初啼”,“小梨园”少儿班的孩子们将表演不同流派的名家名段;三是“戏曲荟萃”,多伦多当地的票友们将以京剧和豫剧串唱同一戏曲人物,越剧与粤剧的同行也将联袂演出;四是“梅花绽放”,旦角班学员们将表演不同流派名家名段;五是“国粹传承”,中国国家一级演员、著名花脸裘派传人、加拿大中国戏曲艺术协会名誉会长杨燕毅将率学员们同台上演经典名段。
加拿大中国戏曲艺术协会会长张燕燕近日对媒体表示,为促进加中两国文化艺术交流,特别是为戏曲艺术交流提供平台,该协会自2015年创立以来每年都在春秋两季举办京剧专场演出,并在新春之际举办新年戏曲晚会,亦参与其他文化机构的演出活动。该协会不仅面向多伦多当地社区推广宣传中国戏曲国粹,且广邀海内外戏曲名家与当地票友联袂在加拿大多地巡回演出。过去三年虽处疫情期间,协会京剧培训班师生仍积极采取应对措施,携手海内外戏曲名家名票,共同打造越洋云端演出,成效突出。
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |